发生了什么

Wellcome Sanger Institute（威康·桑格研究所，一家研究遗传信息的英国机构）和F1000（开放科学出版机构）宣布了一套新流程。它的目标，是把每月发表的基因组简报从约30篇提高到200篇。这里增加的是公开发表的速度，不是每月新测序200个基因组。

基因组，是一个生物全部的DNA信息。基因组简报，是介绍已经完成的参考基因组、并说明数据质量的短文章。它让其他研究者更容易找到、引用和重新使用这些数据。

背景

达尔文生命之树计划由Wellcome Sanger Institute带头，想为英国和爱尔兰能找到的物种测序。发布消息说，目标大约包括3万种生物。这个计划也是地球生物基因组计划的一部分。更大的计划希望让不同团队一起记录地球上的生命。

生命之树入口在Wellcome Open Research平台上于2021年5月启动。现在那里已有1900多篇基因组简报，内容涉及红松鼠、欧亚水獭和报死甲等物种。

为什么重要

读出基因组只是第一步。如果结果没有公开，其他研究者就很难找到、比较和使用。公开的资料可以支持农业、自然保护和医学研究。采集样本的人、给物种分类的人、博物馆伙伴和测序团队，也能得到清楚的署名。新的流程还希望让公开速度赶上测序设备产生数据的速度。

这并不表示流程会直接带来新药或新品种。它先建立一个大家都能使用的资料基础，之后的研究可以在此基础上继续。

怎样检查质量

第一步是电脑辅助检查。流程会记录基因组的连续性、结构准确性、碱基准确性、功能完整度和染色体状态。这些指标会直接放进文章里，读者可以同时看到数据和质量信息。

文章在线发表后，还会接受公开同行评议。受邀专家或评议小组会检查文章。这个方法把自动检查和人的判断结合起来。发布方还说，这套方式已经得到PubMed等索引服务的认可。

已确认和未确认的部分

现在可以确认的是：新流程已经公布，月发表200篇是明确目标。资料也说明了电脑检查和人工评议怎样配合。但目前的消息没有证明这个速度已经长期实现，也没有给出完成约3万种生物的详细时间表。评议人员能否跟上文章数量，也仍然需要观察。

接下来要看什么

接下来应关注每月实际发表多少篇，专家评议是否及时，以及研究者是否真的重新使用这些资料。如果速度提高后，质量指标仍然清楚，基因组简报就可能成为生物多样性研究更有用的公共资料库。

来源：Phys.org报道和F1000公告。